Az epoxy alapfestő vízalapúságának toxikussága kisebb, mint a szolvens-alapú verzióknál. A víz a szolvensek helyettesítőjéül szolgál, ami csökkenti a VOC-t és az égszennyezést. Bár az alapfestő vízben oldható, képessége metallel, betonnel és faakkal való rögzítéshez nem változik. Erős védelmi réteget alkot, amely javítja a következő festékek illeszkedését, miközben korrozión elleni védelmet és zárolóvédelmet nyújt. Az alacsony illatoság és a gyors szárítási idő miatt a vízalapú epoxy alapfestők leginkább otthoni és belseő helyszíneken, valamint olyan helyeken ajánlottak, ahol szigorú környezetvédelmi előírások vannak.